В современных операционных Центрального Таможенного Госпиталя высококвалифицированным врачом-нейрохирургом, прошедшим обучение за рубежом, осуществляются операции различной степени сложности на головном и спинном мозге.

В Центральном Таможенном Госпитале успешно проводятся сложные операции при церебральных аневризмах, артерио-венозной мальформации, стенозе сонной артерии, кровоизлиянии в мозг, а также удаление грыж спинного мозга и др.

Риск нейрохирургических операций в Центральном Таможенном Госпитале сводится к минимуму благодаря применению таких современных технологических систем, как нейромониторинг, интраоперационная ультрасонография, эндоскопия, глиолановое окрашивание, краниотомия в сознательном состоянии.